Visi

"Menjadi Program Magister yang Unggul dan Terkemuka dalam Kajian Pendidikan Agama Islam Berbasis Nilai-nilai Inti UIN Sunan Kalijaga melalui Pendekatan Interdisiplin dan Multidisiplin pada Level Nasional dan Regional Tahun 2025"

Misi

1. Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran jenjang Magister yang interkonektif-integratif, inklusif, dan transformatif.
2. Meningkatkan riset dan kajian keislaman dan keilmuan Pendidikan Agama Islam yang unggul dan berdaya saing.
3. Melaksanakan pengabdian masyarakat berbasis Pendidikan Agama Islam yang inovatif dan memberdayakan.
4. Memperkuat kerjasama-kemitraan yang saling menguntungkan guna akselerasi kemajuan Pendidikan Agama Islam.

Tujuan

1. Menghasilkan lulusan Magister (S2) Pendidikan Agama Islam yang mempunyai kemampuan akademis dan profesional yang integratif-interkonektif
2. Menghasilkan lulusan Magister (S2) Pendidikan Agama Islam yang beriman, berakhlak mulia, memiliki kecakapan sosial dan manajerial, dan berjiwa kewirausahaan (enterpreneurship) serta rasa tanggungjawab sosial kemasyarakatan
3. Menghasilkan lulusan Magister (S2) Pendidikan Agama Islam yang menjunjung tinggi nilai-nilai keilmuan dan kemanusiaan.
4. Menjadikan pogram studi Magister (S2) Pendidikan Agama Islam FITK UIN Sunan Kalijaga sebagai pusat studi yang unggul dalam bidang kajian dan penelitian Pendidikan Agama Islam yang unggul dan berdaya saing.
5. Mengembangkan jaringan kemitraan yang kokoh dan fungsional dengan para pemangku kepentingan Program Studi Magister (S2) Pendidikan Agama Islam.